Blue Lagoon è un gioco di "controllo aree" e "set collection" nel quale i giocatori gestiscono un gruppo di coloni che si sparpagliano per le isole di un arcipelago appena scoperto.
Il gioco si svolge in due fasi (la fase "esplorazione" seguita da quella di" insediamento"). Lungo il corso di ambo le fasi, i giocatori espanderanno la loro presenza sul tabellone aggiungendo un nuovo token ogni turno(colono o villaggio).
Lo scopo è quello di raccogliere le risorse sparse sulla mappa piazzandoci uno dei vosti token sopra. Nella prima fase, si può piazzare un nuovo token ovunque lo si desideri a patto che tocchi una laguna OPPURE un dei tuoi stessi token piazzati in turni precedenti. Nella seconda fase, la plancia viene ripulita, ad eccezione dei villaggi, ed ora ci si può espandere solo da quest'ultimi piazzati nella prima fase! Alla fine di entrambe le fasi, i giocatori ottengono punti vittoria in relazione ai set di risorse che collezionano. Chi avrà più punti vittoria sarà incoronato vincitore!